Температура плавления праймеров
Расчёт Tm праймеров, шпилек и димеров для ПЦР.
Введите праймеры, 5′ → 3′
Праймеры в одной реакции
Проверяются все сочетания, включая самодимеры. Введите полные последовательности, 5′ → 3′.
Учебные последовательности для демонстрации взаимодействий; это не готовый набор для проверки интеграции.
Добавьте минимум два праймера. Расчёт обновляется автоматически.
Расчёт Tm и взаимодействий праймеров
Tm участка отжига: SantaLucia / Owczarzy с учётом солей и dNTP. Шпильки и димеры: Primer3 2.6.1, включая 5′-хвосты.
Границы расчёта
Tₐ — ориентир для температурного градиента. Расчёт не проверяет специфичность на геноме и не предсказывает выход ПЦР.
Шпильки праймеров длиннее 60 нт и димеры двух таких праймеров получают отдельную эвристическую оценку; в ней не учитывается связывание Mg²⁺ с dNTP.
Метка «3′» в смеси обозначает комплементарный конец от 3 оснований и возможность его первого удлинения. Последующие циклы, удлинение шпилек, терминальные несовпадения и коррекция полимеразой не моделируются. Отсутствие найденных структур не исключает артефакты.