Нанопоровое секвенирование плазмид целиком

Секвенируем кольцевую ДНК по всей длине с помощью Oxford Nanopore, чтобы проверить не только выбранные участки, но и остальную последовательность конструкции.

3 900 ₽
за 1 плазмиду
2 900 ₽
при заказе от 10 шт.
Особенности и преимущества Nanopore Посмотрите валидационные данные и сравнение с секвенированием по Сэнгеру.

Как передать образцы

В Москве

Образцы можно отправить Яндекс Доставкой или другим сервисом по адресу: Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10. Заказы принимаем с 11:00 до 18:00. Телефон для связи: +7 (985) 923-73-73.

Как пройти: Главный вход, со стороны пересечения улиц Миклухо-Маклая и академика Волгина. Необходимо пройти мимо памятника валиномицину по лестнице вверх и войти внутрь здания.

После оформления заказа вам напишет менеджер. Для личной передачи образцов вас встретят на проходной ИБХ у главного входа со стороны ул. Миклухо-Маклая.

📦 Из других городов

  • Нужно взять термоконтейнер из пенопласта — короб с плотно закрывающейся крышкой и толстыми стенками.
  • Необходимо дно и боковые стенки выложить замороженными хладоэлементами, в центр поместить плотно закрытый герметичный zip-пакет с образцами и накрыть пакет хладоэлементами сверху.
  • Альтернативный вариант — засыпать в короб колотый лед или сухой лед.

Если плазмиду нельзя отправить в жидком виде, её можно высушить. После высушивания и повторного растворения возможна частичная деградация, поэтому отправьте в 1,5 раза больше рекомендуемого количества ДНК.

Важно знать перед первым заказом

Что мы не берём в работу

  • ПЦР-продукты и линейная дцДНК: для линейных молекул не выполняем сборку последовательности. По запросу можем передать FASTQ-файл; качество чтения линейного фрагмента обычно ниже, чем кольцевой молекулы.
  • Вирус AAV: Линейную одноцепочечную ДНК из вируса не секвенируем. Можно передать плазмиду, с которой он нарабатывается.
  • Геномы бактерий: Данных с одного образца хватит на BAC-хромосомы, но не хватит для сборки целого бактериального генома (3 млн. п.о.).

Контроль качества

Перед отправкой проверьте аликвоту образца с помощью электрофореза.

  • Качественный образец должен содержать основную полосу, соответствующую суперскрученной форме.
  • На геле не должно быть заметного шмера, который может указывать на деградацию.
  • Плотно закрывайте пробирки, чтобы образец не испарился и не деградировал в пути. Перед длительной транспортировкой советуем замотать пробирку парафильмом.

Сроки, данные и оплата

  • Сроки: до 5 рабочих дней. Запуски проводим 2–3 раза в неделю: во вторник и четверг, по средам — в тестовом формате.
  • Результат: передаём итоговые FASTA- и BAM-файлы с прочтениями. Их можно открыть в UGENE.
  • Хранение: Мы не храним остатки образцов, поэтому оставьте себе аликвоту.
  • Оплата: Менеджер свяжется с вами, вышлет ссылку для онлайн-оплаты или обсудит договор.

Юридическая информация

Ознакомьтесь с условиями оказания услуг перед оформлением заказа.

СКАЧАТЬ ДОГОВОР (.DOCX)

Параметры заказа

Добавьте образец

Введите образец вручную или загрузите список
Требования к образцам (Общий объем 2–5 мкл)
До 5 кб: от 150 нг
20‑200 нг/мкл
5–10 кб: от 300 нг
40‑400 нг/мкл
10–20 кб: от 500 нг
100‑600 нг/мкл
20–40 кб: от 600 нг
120‑600 нг/мкл
От 40 кб: от 1 мкг
> 400 нг/мкл
нг/мкл
Если нет референса, укажите размер плазмиды в п.н., округлив в большую сторону до тысяч п.н.
Пример: 3449 → 4000, 8988 → 9000
3 900 ₽

Разделите колонки табуляцией или точкой с запятой

НазваниеКонцентрацияПоследовательность
можно оставить пустойРазмер
только числоКомментарий
Загрузка Excel (.xlsx)
Используйте наш унифицированный шаблон для быстрой обработки заказа:
  • Минимальная концентрация: 20 нг/мкл
  • Для плазмид > 100 кб рекомендуем > 500 нг/мкл
Скачать шаблон .xlsx
Нажмите на кнопку, чтобы загрузить