Секвенируем кольцевую ДНК по всей длине с помощью Oxford Nanopore, чтобы проверить не только выбранные участки, но и остальную последовательность конструкции.
Образцы можно отправить Яндекс Доставкой или другим сервисом по адресу: Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10. Заказы принимаем с 11:00 до 18:00. Телефон для связи: +7 (985) 923-73-73.
Как пройти: Главный вход, со стороны пересечения улиц Миклухо-Маклая и академика Волгина. Необходимо пройти мимо памятника валиномицину по лестнице вверх и войти внутрь здания.
После оформления заказа вам напишет менеджер. Для личной передачи образцов вас встретят на проходной ИБХ у главного входа со стороны ул. Миклухо-Маклая.
📦 Из других городов
Нужно взять термоконтейнер из пенопласта — короб с плотно закрывающейся крышкой и толстыми стенками.
Необходимо дно и боковые стенки выложить замороженными хладоэлементами, в центр поместить плотно закрытый герметичный zip-пакет с образцами и накрыть пакет хладоэлементами сверху.
Альтернативный вариант — засыпать в короб колотый лед или сухой лед.
Если плазмиду нельзя отправить в жидком виде, её можно высушить. После высушивания и повторного растворения возможна частичная деградация, поэтому отправьте в 1,5 раза больше рекомендуемого количества ДНК.
Важно знать перед первым заказом
Какие образцы принимаем
Плазмиды и ампликоны.
Что не берём в работу
Вирус AAV: линейную одноцепочечную ДНК из вируса не секвенируем. Можно передать плазмиду, с которой он нарабатывается.
Геномы бактерий: данных с одного образца хватит на BAC-хромосомы, но не хватит для сборки целого бактериального генома (3 млн. п.о.).
Принимаем с ограничениями
Ампликоны
Сырые прочтения вместо сборки
Результаты передаём в виде сырых .fastq-файлов. Каждый файл содержит всю совокупность сырых прочтений для соответствующего образца. Алгоритмическую сборку полной последовательности не выполняем.
Ограничения качества и покрытия
Не можем гарантировать такие же показатели качества секвенирования, как для плазмид. В частности, не гарантируем высокое покрытие, особенно по краям ампликона.
Контроль качества
Перед отправкой проверьте аликвоту образца с помощью электрофореза.
Для плазмид: основная полоса должна соответствовать суперскрученной форме.
На геле не должно быть заметного шмера, который может указывать на деградацию.
Плотно закрывайте пробирки, чтобы образец не испарился и не деградировал в пути. Перед длительной транспортировкой советуем замотать пробирку парафильмом.
Сроки, данные и оплата
Сроки: до 5 рабочих дней. Запуски проводим 2–3 раза в неделю: во вторник и четверг, по средам — в тестовом формате.
Результат для плазмид: передаём итоговые FASTA- и BAM-файлы с прочтениями. Их можно открыть в UGENE.
Хранение: Мы не храним остатки образцов, поэтому оставьте себе аликвоту.
Оплата: Менеджер свяжется с вами, вышлет ссылку для онлайн-оплаты или обсудит договор.
Юридическая информация
Ознакомьтесь с условиями оказания услуг перед оформлением заказа.
Пробирки для передачи образцовПожалуйста, передавайте образцы только в пробирках типа «Эппендорф» объёмом 0,5 или 1,5 мл. Образцы в пробирках объёмом 200 мкл не принимаем.
нг/мкл
Если нет референса, укажите размер плазмиды в п.н., округлив в большую сторону до тысяч п.н.
Пример: 3449 → 4000, 8988 → 9000
Обратите внимание: Для молекул свыше 40 кб (включая BAC) стоимость не меняется, но потребуется большее количество образца (около 1 мкг). Мы успешно секвенируем молекулы до 150–200 тыс. п.н.
3 900 ₽
Разделите колонки табуляцией или точкой с запятой
НазваниеКонцентрацияПоследовательность можно оставить пустойРазмер только числоКомментарий
Загрузка Excel (.xlsx)
Используйте наш унифицированный шаблон для быстрой обработки заказа: