Проект эксперимента
Последовательности → конструирование → праймеры → проверка ПЦР → реакционная смесь. Выберите запись и продолжите работу в нужном инструменте
Расчёты выполняются в браузере. Проект хранится в этой вкладке: сохраните JSON перед её закрытием. Файл содержит последовательности, исходные аннотации, параметры и версию метода
1. Последовательности и конструкции
Аннотации, CDS и стыки выбранной конструкции
Проверяется стандартный генетический код 1, точные координаты, complement и join. Неполные, удалённые и специальные CDS требуют ручной проверки. При переносе в новую конструкцию сохраняются только однозначно размещённые неизменённые участки; остальные перечислены отдельно
Сравнить исходную и итоговую последовательности
2. Проверка праймеров на матрице
Используется выбранная рабочая запись. Для праймеров из сборки можно подставить сохранённую исходную матрицу. Поиск точных совпадений на обеих цепях; несовпадения, геномная специфичность и эффективность ПЦР здесь не оцениваются
3. Смесь по конечным концентрациям
Исходную и конечную концентрации каждого компонента укажите в одинаковых единицах: мкМ, мМ или кратность буфера. Для фермента задайте Ед/мкл в исходном и конечном растворе. Начальные значения — пример. Это расчёт объёмов; состав и совместимость реагентов выбираются по протоколу
| Компонент и единица | Исходная | Конечная |
|---|
Рабочие разведения применяйте только с совместимым разбавителем; для ферментов проверьте требования к стабилизаторам. Положительный контроль с матрицей входит в число образцов