Оптимизация последовательности ДНК

1

Настройте оптимизацию

Первый организм

Второй организм необязательно

Режим оптимизации

СбалансированныйЧастые кодоны с воспроизводимой вариативностьюРекомендуем МаксимальныйНаиболее частые допустимые кодоны

О методе

Точный динамический поиск основан на алгоритме Condon–Thachuk, 2012. CAI рассчитан по Sharp и Li, 1987

Какие сайты убрать

Для заказа синтеза в КФ сайты BsaI нужно удалить

Свой сайт IUPAC, через запятую

2

Добавьте последовательности

Не более 30 последовательностей за один расчёт

Шаблон XLSX Загрузить файл

Ограничения последовательности и варианты

Окно GC, нт (0 — выключено) Минимум GC, % Максимум GC, % Максимум одинаковых оснований подряд (0 — выключено) Максимум тандемных копий мотива длиной 2–6 нт (0 — выключено) Число попыток

GC проверяется в каждом полном скользящем окне линейной CDS. С ограничениями повторов и GC поиск ограничен 128 состояниями и 30 000 нт. В режиме максимума разные seed могут дать один вариант

Дополнительные параметры

Seed для воспроизводимости

3

Результат

Передать готовые варианты для синтеза в КФ

Последовательности добавятся в заказ. Если вариант пришёл со страницы синтеза, выбранная форма будет сохранена